Die Vereinigung ist als nicht-wirtschaftlicher Verband im Vereinsregister in Berlin und im Register der Interessensverbände beim deutschen Bundestag eingetragen.
Satzungsgemäß wichtigstes Gremium ist die Mitgliederversammlung. Sie wählt ein Präsidium, an dessen Spitze ein Präsident mit zwei Vizepräsidenten und dem Schatzmeister steht. Das Präsidium bestimmt einen Geschäftsführer, der die laufenden Geschäfte der Vereinigung führt.
Alle Mitglieder nehmen an der Verbandsarbeit durch die Teilnahme an Arbeitsgruppen teil, die die Entscheidungen des Präsidiums vorbereiten. Das Präsidium wird durch die Beisitzer in seiner Arbeit unterstützt. Zusätzlich hat die BKS einen wissenschaftlichen Beirat berufen, der das Präsidium durch sein hohes fachliches Know-how unterstützt.
Ein Ombudsmann soll die Einhaltung des Corporate Governance Kodex der BKS insbesondere gegenüber Schuldnern befördern. Er übernimmt im Konfliktfall die Position eines neutralen Ansprechpartners für Betroffene und Öffentlichkeit und dient als unabhängige Schlichtungsstelle.